Entre los principales objetivos del INPA, se destacan:

•  Desarrollar investigaciones científicas en el campo de las ciencias veterinarias
• Incentivar nuevos enfoques orientados a la producción animal sostenible.
• Capacitar y perfeccionar investigadores, profesionales y técnicos mediante la formación de posgrado en el mayor nivel posible.
• Transferir los resultados de las investigaciones a los diferentes sectores interesados.
• Contribuir al mejoramiento de la calidad científico-académica de instituciones y sectores sociales relacionados a la producción agropecuaria .
• Insertar el INPA en el contexto local, nacional e internacional, incentivando la vinculación con redes y el intercambio con otros centros, instituciones y grupos de trabajo en la temática.

*El INPA forma parte de la Red de Seguridad Agroalimentaria (CONICET) y de la Unidad Tecnológica (UT) Salud y Producción Animal (CONICET), de la Comisión Nacional de Sanidad y Bienestar de los Animales Acuáticos de SENASA.